Quintanilla naît le près de Monterrey (Nuevo León, Mexique). À 6 ans, lui, ses parents et ses 3 frères émigrent aux USA. Ils emménagent à San Antonio (Texas) dans une petite maison. Plus tard, il travaille au tri postal.
en , il apprend avec joie qu'il intègre l'Army Air Corps. Il est envoyé à l'Ecole Technique de Radio dans le Wisconsin et l'Ecole Technique de Radar à Boca Raton (Floride). Là-bas, en en , il reçoit son affectation au 72ᵉ Escadron de Bombardiers de la 13ᵉ Air Force. Comme de nombreux autres, il est envoyé dans le Pacifique Sud en , à Samar (République des Philippines).
La fin de la guerre arrive et Quintanilla est débarqué des Army Air Corps à Fort Bliss (Texas) le . Il rentre tout de suite chez lui et intègre l'Université Sainte Marie à moyen-terme en . Le le il obtient la citoyenneté américaine. Il décide d'entamer des études en Physique et obtient son diplôme en .
Service de Sécurité (1951-1959)
en , après avoir passé tous les prérequis, l'USAF lui offre une commission directe en tant que lieutenant en second et il accepte. Il est appelé au service actif en août et affecté au Service de Sécurité de l'USAF. Il y passe 9 ans en tant qu'officier de renseignement, au Q-G de San Antonio, mais aussi en Allemagne et au Japon.
Développement Aérien (1959-1963)
![Quintanilla examinant des débris d'ovnis supposés [Life Magazine]](/time/1/9/6/7/Quintanilla_BlueBook_4.png)
Les 4 années qui suivent, Quintanilla les passe comme Officier Projet de Systèmes au Centre de Développement Aérien de Rome.
Blue Book (1963-1969)
en , il est informé d'une nouvelle affectation à Wright -Patterson, sans que l'on parle d'ovni, ou de responsabilité du projet Blue Book. Quintanilla arrive à Wright-Patterson fin juillet. Le précédent responsable du programme, le lieutenant-colonel Robert J. Friend, lui montre la base, la localisation des principaux bâtiments, et le présente à l'ensemble de ses contacts. Une fois ces formalités effectuées, Quintanilla est présenté au colonel Eric T. de Jonckheere, responsable de l'affectation de Quintanilla.
Le 1er cas sous la responsabilité de Quintanilla arrive le . en , il rédige un article sur la direction d'investigations sur des ovnis s2Quintanilla, H. V. : The investigation of UFOs, Studies in Intelligence, vol. 10, n° 4, automne 1966.
Quintanilla restera directeur du projet Blue Book jusqu'à la fin du projet, en .
Il rédigera aussi un manuscrit sur les ovnis pour le NIDS s3Quintanilla, H. V. : UFO's: An Air Force Dilemma, NIDS 1974, non publié.
Quintanilla décède le à San Antonio (comté de Bexar, Texas) s4LTC Hector Quintanilla Jr. (1923-1998) - Mémorial Find a Grave.